竖井在运行中需要动力，如果排除的地下水是不能利用的高矿化度咸水，还必需修筑专门的输水沟道将咸水送至排水容泄区。竖井排水系统不需要修建大量的排水沟系和田间工程，占用耕地少，且能有效地较大幅度地调控地下水位。
井型 排水竖井的井型多为管井，其结构形式与农田灌溉用水井基本相同。对于以排除地下咸水为主要目的的水井，其过滤管段(花管)必须严格控制在咸水含水层段内，其他部分的管段为实管。在施工时，要采取措施严格封闭咸水层段，以免咸水污染其他含水层。